学校的审计工作始于1984年3月，当时在学校财务科设专职审计员，没有独立的机构，主要对学校财务收支及物资管理进行审计监督；

1986年7月，南阳师专审计科成立，学校配备了专职审计人员，明确了职责和任务；

1989年10月，学校党委把审计科明确为“副处级单位”，直属校长领导；

2001年11月，学校组建监察审计处；

2008年6月成立审计处。

审计处是学校行使审计职能的专门机构，设财务审计科（综合科）、工程审计科两个科室。现有专职审计人员7人，办公室在中区办公楼3楼。审计处同时是河南省内部审计协会、河南省教育审计协会、南阳市内部审计协会的会员单位。校党委审计委员会办公室设在审计处。