骆 翔，曹尚银*，李好先，赵弟广，张富红，陈丽娜，Krishna Poudel，敬 丹，唐丽颖.石榴SUT基因家族鉴定及其在籽粒发育过程中的表达分析. 果树学报2020，37（4）：485-494

摘要：【目的】对石榴SUT家族基因成员进行全基因组鉴定，并分析SUT家族基因成员的结构域特征、启动子序列、生化特征、进化关系和表达特性，为深入研究该基因作用及其分子调控机制提供参考。【方法】利用同源比对及HMMER模型鉴定石榴SUT基因家族成员；利用邻近法和基因结构分析解析石榴SUT基因及其启动子序列的系统发生关系。【结果】共鉴定了10个石榴SUT基因，可以分为3大类；石榴SUT基因及其启动子区的GC含量都明显低于其在拟南芥和水稻中的含量；石榴SUT家族基因GC含量远高于启动子区的GC含量；石榴SUT基因的序列长度与GC含量呈明显正相关；石榴 SUT 基因启动子区含有 10 种 MYB 元件；此外，4 个石榴 SUT 基因 (PgL0328370.1、PgL0099690.1、PgL0145810.1和PgL0145770.1) 在籽粒发育过程中发生了差异表达。【结论】SUT基因在进化过程中其序列和基因结构相对保守，而其启动子序列在进化过程中变化较大，SUT基因的表达量变化与籽粒发育显著相关。

关键词：石榴；SUT；基因家族；籽粒；表达分析