南阳市农业科学院（科学院）是市政府直属的正处级科研机构，实行一个机构两块牌子、一套领导班子，同时挂牌“河南省农业科学院南阳分院”、“河南省科学院南阳分院”。主要从事农作物新品种选育，农业新技术研究，服务农业生产，收集、整理、筛选、引进南阳发展需求的先进科技成果，开展产学研合作及科技发展战略研究等。现有试验田500亩，办公楼6000平方米，作物重点试验室1个，科技图书15万册。

现任院领导班子7人，科级干部24人。现有在职人员155人，本科以上学历97人、硕士研究生以上学历43人，博士研究生2人，副高级以上职称30人，国务院特殊津贴专家2人，省劳模、省学术技术带头人、省科技咨询专家、省党代表、省科技特派员、市人大常委、市政协委员、市拔尖人才、市学术技术带头人等30多人。

内设小麦研究中心、棉花研究中心、植保农化研究所、秋作物研究所、园艺研究所、农业综合技术研究所等6个研究机构、3个职能科室和1个现代农业试验示范基地管理与服务中心。下设南阳市高新技术研究所、南阳市生物技术研究所、南阳市信息技术研究所、南阳市中药材研究所、南阳市工艺美术研究所等5个公益二类事业单位。

年承担国家、省、市重点项目35项，其中国家级项目7项，省级项目27项，市级项目1项。先后加入了10个河南省科技创新协同体，4个河南省品种试验联合体，以及4个河南省科技创新联盟。是国家小麦、棉花、芝麻、食用豆和省玉米、花生、蔬菜、水稻8个现代农业产业技术体系综合试验站、西北农林科技大学南阳小麦试验示范站、博士后科研工作站、省鲜食型花生工程技术中心、市作物新品种重点实验室等项目建设的技术依托单位。

十三五以来，市农科院围绕全面建成小康社会的战略目标，立足当前当地，强化创新，服务“三农”，取得了一批具有自主知识产权的重大农业科技成果，获市厅级以上科技成果奖14项，通过省级以上审（鉴）定及登记备案农作物新品种40多个，获得植物新品种权的新品种20多个；获得国家发明专利4件、国家实用新型专利3件，国家外观设计专利8件，发表论文150余篇，出版论著10余部，编制地方技术标准规程30余项，集成配套技40余项。其中宛麦969、宛玉868、宛花2号、宛杂218等一批主要科研创新成果的推广应用，累计创造社会与经济效益22.4亿元。

先后被评为全省农业科技工作先进单位、省农科系统科技创新先进单位、人才培养先进单位、科技成果转化先进单位、省区试工作先进单位、省科技兴农工作先进单位、省科技咨询AAA级信誉单位、省优秀博士后研发基地、省级卫生单位、“五好”科研院所党组织、粮食生产先进单位。

在全面推进乡村振兴，加快农业农村现代化的新时期，南阳市农科院坚持以科研为重点，以生产为导向，积极调整科研方向和重点，不断提高科技创新能力、转化能力、服务能力，努力打造区域性农业科技创新中心、示范中心、培训中心、信息中心。